Несмотря на то, что сам Пилатес обучал людей определенному набору созданных им упражнений на мате и снарядах, многие из них были слегка модифицированы, чтобы соответствовать духу XXI века. Эти изменения отвечают современным теориям движения и научно обоснованным принципам реабилитации. К стандартным упражнениям Пилатеса были добавлены дополнительные, их часто называют принципами и упражнениями усовершенствованной системы Пилатеса.